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Trascrittomica spaziale — Wikipedia

Source: Wikipedia
Original: https://it.wikipedia.org/wiki/Trascrittomica_spaziale
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Archived: 2026-10-06T00:51:29.098Z
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La trascrittomica spaziale (in inglese spatial transcriptomics) è un insieme di tecnologie che permettono di misurare simultaneamente l'espressione genica e la localizzazione dei trascritti all'interno di sezioni di tessuto. A differenza del sequenziamento dell'RNA in bulk (in inglese bulk RNA-seq), che restituisce una media dell'espressione genica di milioni di cellule, o del sequenziamento dell'RNA a singola cellula (in inglese scRNA-seq), che analizza singole cellule dopo la dissociazione del tessuto, la trascrittomica spaziale conserva la posizione di ciascuna cellula nel tessuto, permettendo di costruire mappe dell'espressione genica che riflettono l'architettura spaziale del campione. Le tecnologie di trascrittomica spaziale si suddividono in due grandi famiglie: la trascrittomica spaziale basata sul sequenziamento (sST), che sfrutta il sequenziamento di nuova generazione (in inglese next generation sequencing NGS), e la trascrittomica spaziale basata sull'imaging (iST), che si basa sull'ibridazione fluorescente in situ o sul sequenziamento dell'RNA in situ. Entrambi gli approcci generano una matrice di espressione genica in cui le righe corrispondono ai geni e le colonne alle posizioni spaziali nel tessuto. La sST offre una copertura ampia del trascrittoma a fronte di una risoluzione spaziale più limitata, mentre la iST raggiunge tipicamente una risoluzione spaziale superiore, arrivando fino al livello della singola molecola: le due famiglie sono quindi complementari e si prestano a scenari applicativi distinti. La trascrittomica spaziale è considerata una componente chiave della biologia spaziale ed è stata nominata Metodo dell'Anno dalla rivista Nature Methods nel 2020. Le sue applicazioni principali riguardano tre domande biologiche: definire la composizione cellulare dei tessuti, studiare le interazioni tra cellule e la loro disposizione spaziale, e mappare le interazioni molecolari attraverso l'analisi delle coppie ligando-recettore.

Tema degli esploratori: calcolo e infrastrutture (deposito sistematico; ricerca «unità di elaborazione grafica»).
Fonte: Wikipedia in italiano, voce «Trascrittomica spaziale» — https://it.wikipedia.org/wiki/Trascrittomica_spaziale
Wikidata Q55633673 (dati Wikidata in CC0 1.0) — https://www.wikidata.org/wiki/Q55633673
Autori: i contributori di Wikipedia (cronologia: https://it.wikipedia.org/wiki/Trascrittomica_spaziale?action=history).
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